Los años 1964 y 1965 fue el primer Becario Científico en la Estación Biológica de Doñana, del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, del Ministerio de Agricultura. Se doctoró en la  Facultad de Veterinaria de Córdoba en septiembre de 1965, tras cursar todos sus estudios como Becas del Patronato de Igualdad de Oportunidades, becado por la misma Facultad y tuvo el honor de ser el primer alumno interno con residencia en el edificio universitario. El mismo año participó en el Primer Curso de Estudios Sociales y Problemas Contemporáneos en El  Puerto de Santa María, organizado por la Universidad de Sevilla.

Por sus trabajos en el desarrollo de la ganadería bovina y porcina en la provincia de Cádiz, recibió el título de CABALLERO de la Orden Civil del Mérito Agrícola, en 1971; dos años después por la misma actividad, más la promoción de industrias agropecuarias en la provincia de Badajoz, el de OFICIAL de dicha Orden; y en 1978, tras 25 años de investigaciones científicas y tecnológicas, logrando notables avances en el manejo científico-práctico del ganado bravo, le fue concedido el título de COMENDADOR de la citada Orden, del Ministerio de Agricultura.

Todos esos avances fueron expuestos entre los años 1965-2004, tanto en España y Portugal como en las Universidades de México, en más de 100 conferencias, cronológicamente en las ciudades de: Sevilla (ATENEO, 1965 y 2000); Salamanca, Madrid (Ministerio de Agricultura, el (24-06-1965); Córdoba (Facultad de Veterinaria); Cádiz, Puerto Real, El Puerto de Santa María (Asociación Cultural Medusa, 1966); Colegios Veterinarios de Sevilla y Badajoz; Colegios Mayores de Sevilla y Córdoba; Auditorio Hotel Monasterio San Miguel, (El Puerto de Santa María, abril de 1992), Algeciras, Ciudad de México (UNAM, 1981); Zacatecas (UAZ,  1985 y 1986); Guadalajara (U. de G. y UAG, en 1988); Aguascalientes (UAG, 1989), etc.

Juan J. Zaldívar Ortega, hombre incansable –aunque como él dice con envidiable honestidad y sinceridad, “… a veces imprudente por su casta brava y noble”, sigue siendo un ejemplo vivo de apasionamiento y dedicación al  estudio del toro bravo, después de publicar decenas de libros sobre sus trabajos de investigación científica y tecnológica aplicada, le pusieron en el camino para modernizar y humanizar los más espectaculares procedimientos en el manejo del ganado bravo, para beneficio de la salud de los animales y de la economía de los ganaderos, “… adelantándose a su tiempo”, como tan acertadamente lo señaló en 1992 el insigne erudito, periodista y escritor, D. Nicolás Salas, ex Director del secular Diario A B C de Sevilla, cuando en abril de ese año presentó en el Auditorio del Hotel Monasterio San Miguel la primera parte de su obra taurina en México.

En su múltiples publicaciones refleja con increíbles imágenes cómo hasta hoy, al cumplirse ya mas medio siglo en que se matriculó Zaldívar por primera vez, en 1952, en la Facultad de Veterinaria de Córdoba, “… ningún otro profesional veterinario ha osado manejar los toros, incluyendo los terroríficos Miuras, en campo abierto y a pecho descubierto, con el apasionado valor, la seguridad, la determinación y efectividad, que Juan José Zaldívar lo hacía.” El doctor veterinario y ganadero de toros de lidia, D. Ramón Sánchez, deja al descubierto la vida profesional de nuestro paisano Juan José, por haber sido testigo excepcional de los hechos. Pero, sobre todo, es un hombre    que vive  recordando con profundo cariño a los profesores que lo formaron y agradeciendo a la Providencia las enseñanzas y el humanismo que de ellos recibió, sin dejar de citar nunca su profunda veneración a su esposa Alicia, a la que dedica los más sentidos elogios y agradecimiento, por haberle comprendido y apoyado su vocación.